<i>IL10</i> GGC Haplotype Is Positively and HLA-<i>DQA1*</i>05<i>-DQB1*</i>02 Is Negatively Associated with Radiographic Progression in Undifferentiated Arthritis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: In rheumatoid arthritis (RA), many genetic markers, such as the shared-epitope (SE) alleles, are described in association with radiographic progression, but limited data are available on undifferentiated arthritis (UA). We investigated whether single-nucleotide polymorphisms (SNP) and haplotypes in immune response genes and HLA class II alleles are associated with radiographic progression in patients with early UA. METHODS: Progression of radiographic damage was determined in white Dutch patients with early UA after 2 years of followup. Severe progression was defined as an increase in Sharp/van der Heijde Score > or = 5 points after 2 years of followup. The remainder was classified as mild. These SNP were genotyped by Taqman technology: tumor necrosis factor (TNF) -1031, -863, -857, -308, -238; lymphotoxin-alpha (LTA) +368, +252; interleukin 10 (IL10) -2849, -1082, -819; IL1A -889, IL1B -31, +3953; and IL1RN +2018. Carriage of SE alleles and HLA-DQA1*05-DQB1*02 haplotype was established. These markers were analyzed in relation to radiographic progression. RESULTS: Forty-eight out of 151 patients with early UA had severe radiographic progression. Severe radiographic progression was associated with an increased carrier frequency of SE alleles (OR 5.12, 95% CI 2.0-13.1, p < 0.001) and IL10 GGC haplotype (OR 2.8, 95% CI 1.4-5.8, p = 0.003). Mild radiographic progression was associated with the HLA-DQA1*05-DQB1*02 haplotype (OR 0.3, 95% CI, 0.1-0.8, p = 0.013) and with allele TNF -308A (OR 0.4, 95% CI, 0.2-0.9, p = 0.02). CONCLUSION: The SE and the IL10 GGC haplotype are associated with severe progression of radiographic damage, in contrast to the DQA1*05-DQB1*02 haplotype and the TNF -308A allele, which are associated with mild radiographic progression in early UA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».