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Enregistrement W1978055814 · doi:10.1186/1471-2350-12-122

A deletion of FGFR2 creating a chimeric IIIb/IIIc exon in a child with Apert syndrome

2011· article· en· W1978055814 sur OpenAlex
Aimée L Fenwick, Sarah Bowdin, Regan EM Klatt, Andrew O.M. Wilkie

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCraniofacial Disorders and Treatments
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesBritish Heart FoundationWellcome Trust
Mots-clésExonApert syndromeBiologyMissense mutationGeneticsFibroblast growth factor receptor 2MutationCancer researchReceptorGeneFibroblast growth factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Signalling by fibroblast growth factor receptor type 2 (FGFR2) normally involves a tissue-specific alternative splice choice between two exons (IIIb and IIIc), which generates two receptor isoforms (FGFR2b and FGFR2c respectively) with differing repertoires of FGF-binding specificity. Here we describe a unique chimeric IIIb/c exon in a patient with Apert syndrome, generated by a non-allelic homologous recombination event. CASE PRESENTATION: We present a child with Apert syndrome in whom routine genetic testing had excluded the FGFR2 missense mutations commonly associated with this disorder. The patient was found to harbour a heterozygous 1372 bp deletion between FGFR2 exons IIIb and IIIc, apparently originating from recombination between 13 bp of identical DNA sequence present in both exons. The rearrangement was not present in the unaffected parents. CONCLUSIONS: Based on the known pathogenesis of Apert syndrome, the chimeric FGFR2 protein is predicted to act in a dominant gain-of-function manner. This is likely to result from its expression in mesenchymal tissues, where retention of most of the residues essential for FGFR2b binding activity would result in autocrine activation. This report adds to the repertoire of rare cases of Apert syndrome for which a pathogenesis based on atypical FGFR2 rearrangements can be demonstrated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,461

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle