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Enregistrement W1978061928 · doi:10.1007/s10545-005-0117-7

A comparative study of cytoplasmic granules imaged by the real‐time microscope, Nile Red and Filipin in fibroblasts from patients with lipid storage diseases

2005· article· en· W1978061928 sur OpenAlexafffund
Nhu‐An Pham, M. Gal, Richard D. Bagshaw, Andreas Mohr, Bruno Chue, T. Richardson, John W. Callahan

Notice bibliographique

RevueJournal of Inherited Metabolic Disease · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNile redFilipinLipid dropletCytoplasmNile blueChemistryBiophysicsLipid bilayerCytoplasmic inclusionBiologyBiochemistryCholesterolMembraneOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cytoplasmic granules in fibroblasts, visualized without stains, or labelled with Nile red, Filipin, or anti-LAMP-1 (lysosome-associated membrane protein 1), were imaged using the real-time microscope (RTM). New advances in light microscope technology were applied to detect cytoplasmic granules (RTM-visible granules) and characterize them by imaging contrast, size, shape, cellular distribution, composition, motion dynamics and quantity. Appearing as solid spheroids or ring structures, the majority of the RTM-visible granules contained Nile-red labelled neutral lipids. A smaller subpopulation, appearing dimmer, with less imaging contrast, contained Filipin-labelled free cholesterol. Most lipid storage granules have a diameter ranging from 0.3 mum to 0.6 mum, with a small population measuring up to 1 mum. They typically clustered in the perinuclear region and displayed relatively small oscillatory motion. Immunofluorescence based on LAMP-1 labelling highlighted granular structures that were distinct and separate from RTM-visible granules and other structures in the light modality of the microscope. RTM-visible granules were associated with disease phenotypes that have increased cellular neutral lipid stores corresponding to the Nile red-labelled droplets (e.g. triacylglycerides, cholesterol esters). As predicted, the fibroblast strains with a defect resulting in Wolman disease, when compared to control samples, consistently had RTM-visible granules, higher in imaging contrast and with larger diameters, that were labelled with Nile red, and also an increased frequency of Filipin-cholesterol complexes. By comparison, in fibroblasts where the lipid storage is less evident (Gaucher and Farber diseases) or from GM(1) gangliosidosis, where the primary storage substances are oligosaccharides, fewer and smaller RTM-visible granules were observed. In some cases, changes in contrast and morphology in the unstained cytoplasmic compartments were more evident than in the labelled structures. In summary, applying the RTM imaging system to fibroblasts enables differences between the various disease types to be seen and, in specific examples, a unique phenotype can be readily discerned.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,699

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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