MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1978066842 · doi:10.1152/ajpcell.00013.2014

Indispensable functions of ABL and PDGF receptor kinases in epithelial adherence of attaching/effacing pathogens under physiological conditions

2014· article· en· W1978066842 sur OpenAlexaff
Carolin F. Manthey, Christine B. Calabio, Anna Wosinski, Elaine Hanson, Bruce A. Vallance, Alex Groisman, Martı́n G. Martı́n, Jean Y. J. Wang, Lars Eckmann

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer Institute
Mots-clésBiologyKinaseABLCitrobacter rodentiumIntiminCell biologyProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcMicrobiologySignal transductionTyrosine kinasePathogenEnterobacteriaceaeBiochemistryEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) and Citrobacter rodentium are attaching-and-effacing (A/E) pathogens that cause intestinal inflammation and diarrhea. The bacteria adhere to the intestinal epithelium, destroy microvilli, and induce actin-filled membranous pedestals but do not invade the mucosa. Adherence leads to activation of several host cell kinases, including FYN, n-SRC, YES, ABL, and ARG, phosphorylation of the bacterial translocated intimin receptor, and actin polymerization and pedestal formation in cultured cells. However, marked functional redundancy appears to exist between kinases, and their physiological importance in A/E pathogen infections has remained unclear. To address this question, we employed a novel dynamic in vitro infection model that mimics transient and short-term interactions in the intestinal tract. Screening of a kinase inhibitor library and RNA interference experiments in vitro revealed that ABL and platelet-derived growth factor (PDGF) receptor (PDGFR) kinases, as well as p38 MAP kinase, have unique, indispensable roles in early attachment of EPEC to epithelial cells under dynamic infection conditions. Studies with mutant EPEC showed that the attachment functions of ABL and PDGFR were independent of the intimin receptor but required bacterial bundle-forming pili. Furthermore, inhibition of ABL and PDGFR with imatinib protected against infection of mice with modest loads of C. rodentium, whereas the kinases were dispensable for high inocula or late after infection. These results indicate that ABL and PDGFR have indispensable roles in early A/E pathogen attachment to intestinal epithelial cells and for in vivo infection with limiting inocula but are not required for late intimate bacterial attachment or high inoculum infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of Physiology-Cell PhysiologyMême sujetEscherichia coli research studiesTravaux en français237 207