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Enregistrement W1978075999 · doi:10.1073/pnas.0906232107

De novo mutations in the gene encoding the synaptic scaffolding protein <i>SHANK3</i> in patients ascertained for schizophrenia

2010· article· en· W1978075999 sur OpenAlexafffund
Julie Gauthier, Nathalie Champagne, Ronald G. Lafrenière, Lan Xiong, Dan Spiegelman, Edna Brustein, Mathieu Lapointe, Huashan Peng, Mélanie Côté, Anne Noreau, Fadi F. Hamdan, Anjené Addington, Judith L. Rapoport, Lynn E. DeLisi, Marie‐Odile Krebs, Ridha Joober, Ferid Fathalli, Fayçal Mouaffak, A. Pejmun Haghighi, Christian Néri, Marie‐Pierre Dubé, Mark Samuels, Claude Marineau, Eric A. Stone, Philip Awadalla, Philip Barker, Salvatore Carbonetto, Pierre Drapeau, Guy A. Rouleau, Kathleen Daignault, Ousmane Diallo, Joannie Duguay, Marina Drits, Édouard Henrion, Philippe Jolivet, Frédéric Kuku, Karine Lachapelle, Guy Laliberté, Sandra B. Laurent, Meijiang Liao, Carlos Marino, Amélie Piton, A Raymond, Annie Reynolds, Daniel Rochefort, Judith St‐Onge, Pascale Thibodeau, Kazuya Tsurudome, Yanlian Yang, Sophie Leroy, Katia Ossian, Mélanie Chayet, David Gourion

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal General HospitalMontreal Neurological Institute and HospitalMontreal Heart InstituteCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesFondation Pierre Deniker pour la Recherche et la Prévention en Santé MentaleUniversité de MontréalGénome QuébecGenome Canada
Mots-clésSchizophrenia (object-oriented programming)ZebrafishScaffold proteinPhenotypeGeneGeneticsBiologyMutationAutismGermlineMutantNeuroscienceMedicinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Schizophrenia likely results from poorly understood genetic and environmental factors. We studied the gene encoding the synaptic protein SHANK3 in 285 controls and 185 schizophrenia patients with unaffected parents. Two de novo mutations (R1117X and R536W) were identified in two families, one being found in three affected brothers, suggesting germline mosaicism. Zebrafish and rat hippocampal neuron assays revealed behavior and differentiation defects resulting from the R1117X mutant. As mutations in SHANK3 were previously reported in autism, the occurrence of SHANK3 mutations in subjects with a schizophrenia phenotype suggests a molecular genetic link between these two neurodevelopmental disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations380
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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