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Enregistrement W1978095503 · doi:10.1186/1471-2180-13-63

Trans-species activity of a nonself recognition domain

2013· article· en· W1978095503 sur OpenAlex
Robert P. Smith, K. Wellman, Myron L. Smith

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyNeurospora crassaRibonucleotide reductaseSaccharomyces cerevisiaePhenotypeCrassaGeneGeneticsProtein subunitYeastMutantCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The ability to distinguish nonself from self is a fundamental characteristic of biological systems. In the filamentous fungus Neurospora crassa, multiple incompatibility genes mediate nonself recognition during vegetative growth. One of these genes, un-24, encodes both nonself recognition function and the large subunit of a type I ribonucleotide reductase, an evolutionarily conserved enzyme that is essential for the conversion of NDP precursors into dNDPs for use in DNA synthesis. Previous studies have shown that co-expression of the two allelic forms of un-24, Oakridge (OR) and Panama (PA), in the same cell results in cell death. RESULTS: We identify a 135 amino acid nonself recognition domain in the C-terminus region of UN-24 that confers an incompatibility-like phenotype when expressed in the yeast, Saccharomyces cerevisiae. Low-level expression of this domain results in several cytological and phenotypic characteristics consistent with an incompatibility reaction in filamentous fungi. These incompatibility phenotypes are correlated with the presence of a non-reducible complex consisting of the PA incompatibility domain and Rnr1p, a large subunit of ribonucleotide reductase in yeast. When the PA incompatibility domain is switched to high-level expression, the incompatibility phenotype transitions to wild-type concomitant with the appearance of a complex containing the PA incompatibility domain and Ssa1p, an Hsp70 homolog. CONCLUSIONS: Results from this study provide insights into the mechanism and control of vegetative nonself recognition mediated by ribonucleotide reductase in N. crassa, thus establishing the yeast system as a powerful tool to study fungal nonself recognition. Our work shows that heat shock proteins may function to deactivate vegetative incompatibility systems, as required for entry into the sexual cycle. Finally, our results suggest that variations on the PA incompatibility domain may serve as novel and specific antimicrobial peptides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle