MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1978128137 · doi:10.1523/jneurosci.2772-08.2008

Identification of Transmembrane Domain 5 as a Critical Molecular Determinant of Menthol Sensitivity in Mammalian TRPA1 Channels

2008· article· en· W1978128137 sur OpenAlexfundno aff
Bailong Xiao, Adrienne E. Dubin, Badry Bursulaya, Veena Viswanath, Timothy Jegla, Ardem Patapoutian

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésTransient receptor potential channelTRPM8MentholChemistryGatingActivator (genetics)Ion channelTransmembrane domainBiophysicsBiochemistryTransmembrane proteinCell biologyReceptorTRPV1Biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TRPA1 is a member of the transient receptor potential (TRP) family of ion channels and is expressed in a subset of nociceptive neurons. An increasing body of evidence suggests that TRPA1 functions as a chemical nocisensor for a variety of reactive chemicals, such as pungent natural compounds and environmental irritants. Activation of TRPA1 by reactive compounds has been demonstrated to be mediated through covalent modification of cytoplasmic cysteines located in the N terminus of the channel, rather than classical lock-and-key binding. TRPA1 activity is also modulated by numerous nonreactive chemicals, but the underlying mechanism is unknown. Menthol, a natural nonreactive cooling compound, is best known as an activator of TRPM8, a related TRP ion channel required for cool thermosensation in vivo. More recently, menthol has been shown to be an activator of mouse TRPA1 at low concentrations, and a blocker, at high concentrations. Here, we show that human TRPA1 is only activated by menthol, whereas TRPA1 from nonmammalian species are insensitive to menthol. Mouse-human TRPA1 chimeras reveal the pore region [including transmembrane domain 5 (TM5) and TM6] as the critical domain determining whether menthol can act as an inhibitor. Furthermore, chimeras between Drosophila melanogaster and mammalian TRPA1 highlight specific residues within TM5 critical for menthol responsiveness. Interestingly, this TM5 region also determines the sensitivity of TRPA1 to other chemical modulators. These data suggest separable structural requirements for modulation of TRPA1 by covalent and nonreactive molecules. Whether this region is involved in binding or gating of TRPA1 channels is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations317
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of NeuroscienceMême sujetIon Channels and ReceptorsTravaux en français237 207