Oxygen toxicity and the health and survival of eukaryote cells: A new piece is added to the puzzle
Notice bibliographique
Résumé
My first thought was “Superoxide dismutase: of what use is that to a cell?” It was 1976 and I was a graduate student in search of a topic for a “literature” seminar. Fortunately I chose to present the story of this exotic-sounding protein, “SOD,” to my colleagues and was rewarded with the beginnings of a long-term fascination with the concept that our aerobic (O2-based) lifestyle is fraught with oxidative (O2-based) hazards. This concept is now firmly linked to topics of enduring interest and importance such as aging, cancer, ischemia (anoxic tissue damage), aerotolerance, and immune system function. In this issue of PNAS, Luk et al . (1), using brewer's yeast cells, show how a key eukaryote antioxidant enzyme, mitochondrial Mn-cofactored SOD (SOD2), acquires its Mn cofactor and possibly its active conformation via a previously uncharacterized nuclear-encoded protein, thus providing both a tool for experimental oxy-radical stress manipulations and a more detailed understanding of how eukaryote cell oxygen defenses are assembled. By the 1960s it was clear that reactive oxygen species (ROS), namely, partially reduced O2 derivatives such as hydrogen peroxide (H2O2), the hydroxyl radical (*OH), and the superoxide anion radical (O2-) formed by ionizing radiation could oxidize and damage cell proteins, lipids, and nucleic acids. However, there was little convincing evidence that either O2-mediated damage or ROS were produced by normal respiratory (dioxygen-reducing) cellular processes. This changed in 1969 when McCord and Fridovich (2) demonstrated that the catalytic activity of a long-known red blood cell protein of unknown function, erythrocuprein, was to specifically dismute O2- to H2O2 and O2. If O2- were not a real and present danger, why would red cells contain an enzyme specifically degrading it? …
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,004 |
| Communication savante | 0,006 | 0,010 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,010 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».