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Enregistrement W1978347913 · doi:10.1118/1.4747269

Discrimination of gastric cancer from normal by serum RNA based on surface‐enhanced Raman spectroscopy (SERS) and multivariate analysis

2012· article· en· W1978347913 sur OpenAlexafffund
Yanping Chen, Gang Chen, Xiongwei Zheng, Cheng He, Shangyuan Feng, Yan Chen, Xiaoqian Lin, Rong Chen, Haishan Zeng

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesProgram for Changjiang Scholars and Innovative Research Team in UniversityCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésRaman spectroscopySurface-enhanced Raman spectroscopyRNACancerPrincipal component analysisMultivariate analysisChemistryMedicineInternal medicineAnalytical Chemistry (journal)Materials sciencePathologyMolecular biologyBiologyBiochemistryRaman scatteringChromatographyComputer scienceOpticsArtificial intelligenceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Here, the authors explore the feasibility of discriminating cancer patients from healthy controls by serum RNA detection based on surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) and multivariate analysis. METHODS: MgSO(4)-aggregated silver nanoparticles (Ag NP) as the SERS-active substrate presented strong SERS signals to RNA. SERS measurements were performed on two groups of serum RNA samples: one group from patients (n = 31) with gastric cancer and the other group from healthy volunteers (n = 34). RESULTS: Tentative assignments of the Raman bands in the normalized SERS spectra demonstrated that there are differential expressions of circulating RNA between the gastric cancer group and the control group. Principal component analysis (PCA) combined with linear discriminate analysis (LDA) was introduced to differentiate gastric cancer from normal and achieved sensitivity of 100% and specificity of 94.1%. CONCLUSIONS: This exploratory study demonstrated potential for developing serum RNA SERS analysis into a useful clinical tool for noninvasive screening and detection of cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,136
Score d'incertitude au seuil0,500

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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