MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1978395865 · doi:10.1002/humu.20819

Identification of 34 novel and 56 known<i>FOXL2</i>mutations in patients with blepharophimosis syndrome

2008· article· en· W1978395865 sur OpenAlexaff
Diane Beysen, Sarah De Jaegere, David J. Amor, Philippe Bouchard, Sophie Christin-Maître, Marc Fellous, Philippe Touraine, Arthur W. Grix, Raoul C. M. Hennekam, Françoise Meire, Nina Øyen, Louise C. Wilson, Dalit Barel, Jill Clayton‐Smith, Thomy de Ravel, Christian Decock, Patricia Delbeke, Regina Ensenauer, Friedrich Ebinger, Gabriele Gillessen‐Kaesbach, Yvonne Hendriks, Virginia Kimonis, Rachel Laframboise, Paul Laissue, Kathleen A. Leppig, Bart P. Leroy, David T. Miller, David Mowat, Luitgard M. Neumann, Astrid S. Plomp, Nicole Van Regemorter, Dagmar Wieczorek, Reiner A. Veitia, Anne De Paepe

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesVlaamse regeringUniversiteit GentFonds Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésBlepharophimosisBiologyIdentification (biology)GeneticsComputational biologyPtosisBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blepharophimosis syndrome (BPES) is caused by loss-of-function mutations in the single-exon forkhead transcription factor gene FOXL2 and by genomic rearrangements of the FOXL2 locus. Here, we focus on 92 new intragenic FOXL2 mutations, 34 of which are novel. Specifically, we found 10 nonsense mutations (11%), 13 missense mutations (14%), 40 deletions or insertions leading to a frameshift (43%), and 29 in-frame changes (32%), of which 28 (30%) lead to a polyalanine expansion. This study confirms the existence of two previously described mutational hotspots. Moreover, we gained novel insights in genotype-phenotype correlations, emphasizing the need to interpret genotype-phenotype correlations individually and always in the context of further clinical observations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHuman MutationMême sujetBlood groups and transfusionTravaux en français237 207