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Enregistrement W1978685923 · doi:10.1002/jlcr.1902

Expression and purification of an isotopically labeled aggregation prone inducible nitric oxide synthase calmodulin‐binding protein for use in nuclear magnetic resonance studies

2011· article· en· W1978685923 sur OpenAlexaff
Michael Piazza, Yay Duangkham, Donald E. Spratt, Thorsten Dieckmann, J. Guy Guillemette

Notice bibliographique

RevueJournal of Labelled Compounds and Radiopharmaceuticals · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNitric Oxide and Endothelin Effects
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryCalmodulinPeptideNitric oxide synthaseBiochemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyPeptide sequenceBinding proteinEnzymeStereochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy is an efficient method for studying the dynamics and structures of protein‐protein and protein‐peptide complexes. Calmodulin (CaM), a ubiquitous Ca 2+ ‐sensing protein, is able to bind and regulate various intracellular proteins, including the nitric oxide synthase (NOS) enzymes. The investigation of CaM bound to the CaM‐binding region of the inducible nitric oxide synthase (iNOS) isoform of NOS proved to be difficult due to the propensity of the iNOS CaM‐binding domain to aggregate when not bound to CaM. In the present study, an isotopically labeled peptide of the CaM‐binding region of iNOS has successfully been expressed and purified. The peptide identity was verified by both sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis and mass spectroscopy and further characterized by NMR spectroscopy. These results demonstrate an efficient approach for the expression and purification of individually stable isotope labeled protein complexes for NMR analysis, even if one partner is prone to aggregation or has very low solubility. This technique can also be used to label a specific type of amino acid or radiolabel all of the amino acids in one of the components participating in a protein–protein or protein–peptide complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,465

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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