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Enregistrement W1978742484 · doi:10.1093/brain/awu026

Leukoencephalopathy with brainstem and spinal cord involvement and lactate elevation: clinical and genetic characterization and target for therapy

2014· article· en· W1978742484 sur OpenAlexaff
Laura van Berge, Eline M. Hamilton, Tarja Linnankivi, G. Uziel, Marjan E. Steenweg, Pirjo Isohanni, Nicole I. Wolf, Ingeborg Krägeloh‐Mann, N. J. Brautaset, P. Ian Andrews, Brigit A. de Jong, Malak Al Ghamdi, Wessel N. van Wieringen, Bakhos A. Tannous, Esther Hulleman, T. Wurdinger, Carola G.M. van Berkel, Emiel Polder, Truus E. M. Abbink, Eduard A. Struys, Gert C. Scheper, Marjo S. van der Knaap, F. Alehan, Richard Appleton, Eugen Boltshauser, Knut Brockmann, E Calado, A. Carius, I.F.M. de Coo, Rudy Van Coster, S. El-Zind, Л. М. Фадеева, Annette Feigenbaum, Sarenur Gökben, Mark Gorman, Sheffali Gulati, P. Hnevsova, Kairit Joost, Wolfgang Köhler, Anneli Kolk, Wolfgang Kristoferitsch, Elizabeth Lemos Silveira, Jaime Lin, S. Lutz, Carla Mendonça, C. Nuttin, Thomas Opladen, M. Savoiardo, Raphael Schiffmann, Angelika Seitz, S V Serkov, Shruti Sharma, Sylvia Stöckler, I. Karen Temple, Kayıhan Uluç, S. Vojta, Guy Wilms, Betty Wong, Zühal Yapıcı

Notice bibliographique

RevueBrain · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeukoencephalopathyDiseaseMedicineSplice site mutationMutationCompound heterozygosityGenotypePhenotypeRNA splicingInternal medicineGeneticsBiologyBioinformaticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leukoencephalopathy with brainstem and spinal cord involvement and lactate elevation is a disorder caused by recessive mutations in the gene DARS2, which encodes mitochondrial aspartyl-tRNA synthetase. Recent observations indicate that the phenotypic range of the disease is much wider than initially thought. Currently, no treatment is available. The aims of our study were (i) to explore a possible genotype-phenotype correlation; and (ii) to identify potential therapeutic agents that modulate the splice site mutations in intron 2 of DARS2, present in almost all patients. A cross-sectional observational study was performed in 78 patients with two DARS2 mutations in the Amsterdam and Helsinki databases up to December 2012. Clinical information was collected via questionnaires. An inventory was made of the DARS2 mutations in these patients and those previously published. An assay was developed to assess mitochondrial aspartyl-tRNA synthetase enzyme activity in cells. Using a fluorescence reporter system we screened for drugs that modulate DARS2 splicing. Clinical information of 66 patients was obtained. The clinical severity varied from infantile onset, rapidly fatal disease to adult onset, slow and mild disease. The most common phenotype was characterized by childhood onset and slow neurological deterioration. Full wheelchair dependency was rare and usually began in adulthood. In total, 60 different DARS2 mutations were identified, 13 of which have not been reported before. Except for 4 of 42 cases published by others, all patients were compound heterozygous. Ninety-four per cent of the patients had a splice site mutation in intron 2. The groups of patients sharing the same two mutations were too small for formal assessment of genotype-phenotype correlation. However, some combinations of mutations were consistently associated with a mild phenotype. The mitochondrial aspartyl-tRNA synthetase activity was strongly reduced in patient cells. Among the compounds screened, cantharidin was identified as the most potent modulator of DARS2 splicing. In conclusion, the phenotypic spectrum of leukoencephalopathy with brainstem and spinal cord involvement and lactate elevation is wide, but most often the disease has a relatively slow and mild course. The available evidence suggests that the genotype influences the phenotype, but because of the high number of private mutations, larger numbers of patients are necessary to confirm this. The activity of mitochondrial aspartyl-tRNA synthetase is significantly reduced in patient cells. A compound screen established a 'proof of principle' that the splice site mutation can be influenced. This finding is promising for future therapeutic strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations107
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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