1H NMR metabolomics of earthworm responses to sub-lethal PAH exposure
Notice bibliographique
Résumé
Environmental context. Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are common contaminants, but there has been limited research investigating the responses of earthworm exposure to sub-lethal PAH concentrations. In this study, 1H nuclear magnetic resonance (NMR) metabolomics was used to characterise the metabolic responses of Eisenia fetida earthworm exposure in contact tests to 10, 50 and 100 µg cm–2 naphthalene, phenanthrene and pyrene. The findings of this study highlight the potential of metabolomics as a tool for monitoring earthworm responses to sub-lethal concentrations of problematic environmental contaminants. Abstract. Metabolic responses of earthworm exposure to the polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) naphthalene, phenanthrene and pyrene in contact tests were measured using 1H nuclear magnetic resonance (NMR). Novel metabolites were not detected but principal component analysis (PCA) showed that earthworms exposed to 10, 50 and 100 µg cm–2 naphthalene, phenanthrene and pyrene differed from unexposed (control) earthworms. Partial least-squares-discriminant analysis (PLS-DA) showed that earthworms had statistically significant responses to PAH exposure, except for 10 µg cm–2 naphthalene and 50 µg cm–2 pyrene. Leucine, valine, alanine, lysine and maltose were identified as potential response indicators of PAH exposure, but whether the concentration of these metabolites increased or decreased was PAH- and concentration-dependent. These initial findings reveal the potential of metabolomics for monitoring earthworm responses to sub-lethal PAH exposure and highlight the role of metabolomics as a future tool in ecotoxicology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».