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Enregistrement W1978770772 · doi:10.1071/en09054

1H NMR metabolomics of earthworm responses to sub-lethal PAH exposure

2009· article· en· W1978770772 sur OpenAlexaff
Sarah Anne Brown, André J. Simpson, Myrna J. Simpson

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEisenia fetidaChemistryPyreneEarthwormPhenanthreneEnvironmental chemistryMetabolomicsNaphthalenePolycyclic aromatic hydrocarbonContext (archaeology)ToxicityChromatographyOrganic chemistryBiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Environmental context. Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are common contaminants, but there has been limited research investigating the responses of earthworm exposure to sub-lethal PAH concentrations. In this study, 1H nuclear magnetic resonance (NMR) metabolomics was used to characterise the metabolic responses of Eisenia fetida earthworm exposure in contact tests to 10, 50 and 100 µg cm–2 naphthalene, phenanthrene and pyrene. The findings of this study highlight the potential of metabolomics as a tool for monitoring earthworm responses to sub-lethal concentrations of problematic environmental contaminants. Abstract. Metabolic responses of earthworm exposure to the polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) naphthalene, phenanthrene and pyrene in contact tests were measured using 1H nuclear magnetic resonance (NMR). Novel metabolites were not detected but principal component analysis (PCA) showed that earthworms exposed to 10, 50 and 100 µg cm–2 naphthalene, phenanthrene and pyrene differed from unexposed (control) earthworms. Partial least-squares-discriminant analysis (PLS-DA) showed that earthworms had statistically significant responses to PAH exposure, except for 10 µg cm–2 naphthalene and 50 µg cm–2 pyrene. Leucine, valine, alanine, lysine and maltose were identified as potential response indicators of PAH exposure, but whether the concentration of these metabolites increased or decreased was PAH- and concentration-dependent. These initial findings reveal the potential of metabolomics for monitoring earthworm responses to sub-lethal PAH exposure and highlight the role of metabolomics as a future tool in ecotoxicology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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