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Enregistrement W1978774685 · doi:10.1080/14660820500443000

Methods to rapidly and accurately screen a large number of ENU mutagenized mice for abnormal motor phenotypes

2006· article· en· W1978774685 sur OpenAlexaff
W Abramow-Newerly, Tatiana V. Lipina, Maria Abramow‐Newerly, Daniel Kim, Allison R. Bechard, Gang Xie, Steve J. Clapcote, John Roder

Notice bibliographique

RevueAmyotrophic Lateral Sclerosis · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and Stroke
Mots-clésBody weightBiologyGrip strengthRotarod performance testPhenotypeAudiologyPhysiologyGeneticsMedicineMotor activityEndocrinologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In a dominant genetic screen for late-onset motor impairments in mice, 16-20-week-old N-nitroso-N-ethylurea (ENU)-mutagenized females were subjected to a behavioural test battery consisting of a visual assessment followed by the vertical pole, rotarod and grip strength tests. SOD1-G93A transgenic mice were tested in parallel as a positive control to provide information on the validity and sensitivity of the screen. From among the 1500 G1 ENU mice screened, four affected mice with impaired motor function were classified as outliers. Approximately 32% of the G2 and G3 progeny of one outlier were affected. Vertical pole, rotarod and grip strength test scores were significantly correlated with each other and with body weight in the G1 progeny, but the correlation with body weight was not maintained in the G2 and G3 progeny. We found that two tests, tail suspension and vertical pole, were sufficient to distinguish ENU outliers and SOD1-G93A hemizygotes from control mice, and could detect abnormalities earlier and more frequently than the other tests employed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,841
Score d'incertitude au seuil0,660

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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