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Enregistrement W1978815746 · doi:10.1021/jm050142+

Structure-Based Design, Synthesis, and Memapsin 2 (BACE) Inhibitory Activity of Carbocyclic and Heterocyclic Peptidomimetics

2005· article· en· W1978815746 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryCyclopentanoneStereochemistryCyclopentaneCocrystalPeptidomimeticSelectivityCrystal structureAlicyclic compoundMoleculeHydrogen bondOrganic chemistryPeptide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecular modeling based on the X-ray crystal structure of the Tang-Ghosh heptapeptide inhibitor 1 (OM99-2) of BACE led to the design and synthesis of a series of constrained P(1)' analogues. A cyclopentane ring was incorporated in 1 spanning the P(1)' Ala methyl group and the adjacent methylene carbon atom of the chain. Progressive truncation at the P(2)'-P(4)' sites led to a potent truncated analogue 5 with good selectivity over Cathepsin D. Using the same backbone replacement concept, a series of cyclopentane, cyclopentanone, tetrahydrofuran, pyrrolidine, and pyrrolidinone analogues were synthesized with considerable variation at the P and P' sites. The cyclopentanone and 2-pyrrolidinone analogues 45 and 57 showed low nM BACE inhibition. X-ray cocrystal structures of two analogues 5 and 45 revealed excellent convergence with the original inhibitor 1 structure while providing new insights into other interactions which could be exploited for future modifications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,592

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle