MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1979024706 · doi:10.1016/j.neuroimage.2014.04.018

Individualized Gaussian process-based prediction and detection of local and global gray matter abnormalities in elderly subjects

2014· article· en· W1979024706 sur OpenAlexfundno aff
Gabriel Ziegler, Gerard R. Ridgway, Robert Dahnke, Christian Gaser

Notice bibliographique

RevueNeuroImage · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueGaussian Processes and Bayesian Inference
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingUniversity of California, San DiegoNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, Los AngelesGenentechNational Institutes of HealthServierEisaiBundesministerium für Bildung und ForschungNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaAlzheimer's AssociationAmorfix Life SciencesDeutscher Akademischer AustauschdienstNational Center for Research ResourcesF. Hoffmann-La RocheMedpaceAstraZenecaEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNovartis Pharmaceuticals CorporationWellcome TrustSynarcBayer HealthCareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMedical Research CouncilMeso Scale DiagnosticsFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésNormativeInferenceDementiaPsychologyDiseaseArtificial intelligenceMedicineMachine learningComputer sciencePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Structural imaging based on MRI is an integral component of the clinical assessment of patients with potential dementia. We here propose an individualized Gaussian process-based inference scheme for clinical decision support in healthy and pathological aging elderly subjects using MRI. The approach aims at quantitative and transparent support for clinicians who aim to detect structural abnormalities in patients at risk of Alzheimer's disease or other types of dementia. Firstly, we introduce a generative model incorporating our knowledge about normative decline of local and global gray matter volume across the brain in elderly. By supposing smooth structural trajectories the models account for the general course of age-related structural decline as well as late-life accelerated loss. Considering healthy subjects' demography and global brain parameters as informative about normal brain aging variability affords individualized predictions in single cases. Using Gaussian process models as a normative reference, we predict new subjects' brain scans and quantify the local gray matter abnormalities in terms of Normative Probability Maps (NPM) and global z-scores. By integrating the observed expectation error and the predictive uncertainty, the local maps and global scores exploit the advantages of Bayesian inference for clinical decisions and provide a valuable extension of diagnostic information about pathological aging. We validate the approach in simulated data and real MRI data. We train the GP framework using 1238 healthy subjects with ages 18-94 years, and predict in 415 independent test subjects diagnosed as healthy controls, Mild Cognitive Impairment and Alzheimer's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations94
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuroImageMême sujetGaussian Processes and Bayesian InferenceTravaux en français237 207