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Correction: Systems Analysis of a RIG-I Agonist Inducing Broad Spectrum Inhibition of Virus Infectivity

2013· article· en· W1979074851 sur OpenAlexafffund
Marie-Line Goulet, David Olagnier, Zheng-Yun Xu, Suzanne Paz, S. Mehdi Belgnaoui, Erin I. Lafferty, Valérie Janelle, Meztli Arguello, Marilène Paquet, Zhong He, Khader Ghneim, Stephanie Richards, Andrew Smith, Peter Wilkinson, Mark Cameron, Ulrich Kalinke, Salman T. Qureshi, Alain Lamarre, Elias K. Haddad, Rafick‐Pierre Sékaly, Suraj Peri, Siddharth Balachandran, Rongtuan Lin, John Hiscott

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill University Health CentreArmand Frappier MuseumMcGill UniversityInstitut National de la Recherche ScientifiqueJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInfectivityBroad spectrumAgonistSpectrum (functional analysis)VirologyVirusComputational biologyBiologyChemistryPhysicsReceptorGeneticsCombinatorial chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The RIG-I like receptor pathway is stimulated during RNA virus infection by interaction between cytosolic RIG-I and viral RNA structures that contain short hairpin dsRNA and 59 triphosphate (59ppp) terminal structure. In the present study, an RNA agonist of RIG-I was synthesized in vitro and shown to stimulate RIG-I-dependent antiviral responses at concentrations in the picomolar range. In human lung epithelial A549 cells, 59pppRNA specifically stimulated multiple parameters of the innate antiviral response, including IRF3, IRF7 and STAT1 activation, and induction of inflammatory and interferon stimulated genes -hallmarks of a fully functional antiviral response. Evaluation of the magnitude and duration of gene expression by transcriptional profiling identified a robust, sustained and diversified antiviral and inflammatory response characterized by enhanced pathogen recognition and interferon (IFN) signaling. Bioinformatics analysis further identified a transcriptional signature uniquely induced by 59pppRNA, and not by IFNa-2b, that included a constellation of IRF7 and NF-kB target genes capable of mobilizing multiple arms of the innate and adaptive immune response. Treatment of primary PBMCs or lung epithelial A549 cells with 59pppRNA provided significant protection against a spectrum of RNA and DNA viruses. In C57Bl/6 mice, intravenous administration of 59pppRNA protected animals from a lethal challenge with H1N1 Influenza, reduced virus titers in mouse lungs and protected animals from virus-induced pneumonia. Strikingly, the RIG-I-specific transcriptional response afforded partial protection from influenza challenge, even in the absence of type I interferon signaling. This systems approach provides transcriptional, biochemical, and in vivo analysis of the antiviral efficacy of 59pppRNA and highlights the therapeutic potential associated with the use of RIG-I agonists as broad spectrum antiviral agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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