Localization of <sup>23</sup>Na<sup>+</sup> in a DNA Quadruplex by High-Field Solid-State NMR
Notice bibliographique
Résumé
Monovalent cations such as Na +, K +, and NH 4 + are known to stabilize DNA quadruplexes formed of guanine-quartets. Such structures readily form from the guanine-rich repeat sequences found in telomeres, the physical ends of eukaryotic chromosomes. We present a solid-state NMR approach for studying ions associated with G-quartets based on the direct NMR observation of 23 Na + ion resonances and report new methods for studying quadrupolar nuclei in biological solids. In the tetraplex forming oligonucleotide d(TG 4 T), high-field (17.6 T) NMR spectra cleanly resolve three distinct classes of sodium ions. A high-resolution 2D-MQMAS spectrum established the assignment of an amorphously broadened signal at −19 ppm (relative to 0.1 M NaCl) to surface-bound Na + ions. Two-dimensional nutation spectroscopy was used to indicate the relative size of the quadrupole coupling for each line, while a standard exchange experiment established a correlation between surface (−19 ppm) and channel-bound (6.8 ppm) Na + ions. Finally, free sodium ions are observed at 0 ppm. This work demonstrates the utility of high field spectroscopy in combination with a suite of 2D solid-state NMR experiments for resolving and assigning multiple Na + sites in [d(TG 4 T)] 4 .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».