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Enregistrement W1979153190 · doi:10.1074/jbc.m808431200

Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein L Is a Subunit of Human KMT3a/Set2 Complex Required for H3 Lys-36 Trimethylation Activity in Vivo

2009· article· en· W1979153190 sur OpenAlexaboutno aff
Jingwei Xie, Chengzu Long, Hediye Erdjument‐Bromage, Xiaojun Ding, Yong Zheng, Paul Tempst, She Chen, Bing Zhu, Danny Reinberg

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthMinistry of Science and Technology of the People's Republic of ChinaUniversity of PennsylvaniaNational Institute of General Medical SciencesDirectorate for Biological SciencesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésHistone H3BiologyRibonucleoproteinMolecular biologyHistone methyltransferaseProtein subunitMethylationHistoneTranscription (linguistics)Heterogeneous nuclear ribonucleoproteinCell biologyHistone H2AChemistryBiochemistryRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The presence of histone H3 lysine 36 methylation (H3K36me) correlates with actively transcribed genes. In yeast, histone H3K36me mediated by KMT3 (also known as Set2) recruits a histone deacetylase complex, Rpd3s, to ensure the fidelity of transcription initiation. We report the purification of human KMT3a (also known as HYPB or hSet2) complex and the identification of a novel, higher eukaryotic specific subunit, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L (HnRNP-L). Interestingly, although KMT3a has intrinsic activity in vitro, HnRNP-L is essential in vivo. Moreover, KMT3a generates mono-, di-, and trimethylated products in vitro, but RNA interference against KMT3a or HnRNP-L down-regulates exclusively the H3K36me3 mark in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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