Identification of Eukaryotic and Prokaryotic Methylthiotransferase for Biosynthesis of 2-Methylthio-N6-threonylcarbamoyladenosine in tRNA
Notice bibliographique
Résumé
Bacterial and eukaryotic transfer RNAs have been shown to contain hypermodified adenosine, 2-methylthio-N(6)-threonylcarbamoyladenosine, at position 37 (A(37)) adjacent to the 3'-end of the anticodon, which is essential for efficient and highly accurate protein translation by the ribosome. Using a combination of bioinformatic sequence analysis and in vivo assay coupled to HPLC/MS technique, we have identified, from distinct sequence signatures, two methylthiotransferase (MTTase) subfamilies, designated as MtaB in bacterial cells and e-MtaB in eukaryotic and archaeal cells. Both subfamilies are responsible for the transformation of N(6)-threonylcarbamoyladenosine into 2-methylthio-N(6)-threonylcarbamoyladenosine. Recently, a variant within the human CDKAL1 gene belonging to the e-MtaB subfamily was shown to predispose for type 2 diabetes. CDKAL1 is thus the first eukaryotic MTTase identified so far. Using purified preparations of Bacillus subtilis MtaB (YqeV), a CDKAL1 bacterial homolog, we demonstrate that YqeV/CDKAL1 enzymes, as the previously studied MTTases MiaB and RimO, contain two [4Fe-4S] clusters. This work lays the foundation for elucidating the function of CDKAL1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».