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Enregistrement W1979425616 · doi:10.1074/jbc.m407965200

Analysis of the Third Transmembrane Domain of the Human Type 1 Angiotensin II Receptor by Cysteine Scanning Mutagenesis

2004· article· en· W1979425616 sur OpenAlexafffund
Stéphane Martin, Antony A. Boucard, Martin Clément, Emanuel Escher, Richard Leduc, Gaétan Guillemette

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMutagenesisCysteineTransmembrane domainAngiotensin IITransmembrane proteinReceptorDomain (mathematical analysis)ChemistryCell biologyBiologyBiochemistryMutationGeneMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Activation of G protein-coupled receptors by agonists involves significant movement of transmembrane domains (TMD) following agonist binding. The underlying structural mechanism by which receptor activation takes place is largely unknown but can be inferred by detecting variability within the environment of the ligand-binding pocket, which is a water-accessible crevice surrounded by the seven TMD helices. Using the substituted-cysteine accessibility method, we identified the residues within the third TMD of the wild-type angiotensin II (AT1) receptor that contribute to the formation of the binding site pocket. Each residue within the Ile103-Tyr127 region was mutated one at a time to a cysteine. Treating the A104C, N111C, and L112C mutant receptors with the charged sulfhydryl-specific alkylating agent methanethiosulfonate-ethylammonium (MTSEA) strongly inhibited ligand binding, which suggests that these residues orient themselves within the water-accessible binding pocket of the AT1 receptor. Interestingly, this pattern of acquired MTSEA sensitivity was altered for TMD3 reporter cysteines engineered in a constitutively active AT1 receptor. Indeed, two additional mutants (S109C and V116C) were found to be sensitive to MTSEA treatment. Our results suggest that constitutive activation of the AT1 receptor causes a minor counterclockwise rotation of TMD3, thereby exposing residues, which are not present in the inactive state, to the binding pocket. This pattern of accessibility of residues in the TMD3 of the AT1 receptor parallels that of homologous residues in rhodopsin. This study identified key elements of TMD3 that contribute to the activation of class A G protein-coupled receptors through structural rearrangements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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