WaaP of Pseudomonas aeruginosa Is a Novel Eukaryotic Type Protein-tyrosine Kinase as Well as a Sugar Kinase Essential for the Biosynthesis of Core Lipopolysaccharide
Notice bibliographique
Résumé
WaaP of P. aeruginosa is a crucial sugar kinase that phosphorylates HepI in the inner core region of lipopolysaccharide (LPS). WaaP shares homology with eukaryotic protein kinases in the conserved functional motifs (I-IX), indicating that it is also a protein kinase. This interpretation is substantiated by several lines of evidence including the following: (i) site-directed mutagenesis on catalytic domain residues abrogated the protein kinase activity; (ii) positive reaction in immunoblotting with anti-phosphotyrosine monoclonal antibody PY20; (iii) matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry and proteolytic peptide mapping showing excess mass equivalent to eight phosphate substituents on the tyrosine residues in WaaP; and (iv) WaaP is capable of catalyzing tyrosine self-phosphorylation as well as phosphorylating an exogenous synthetic co-polymer poly(Glu, Tyr). Thus, WaaP possesses dual kinase functions, and it utilizes a catalytic mechanism similar to that of the eukaryotic protein kinases. WaaP was localized to the cytoplasm, suggesting that phosphorylation of the LPS core occurred prior to translocation to the periplasm and attachment of O-antigen. A chemiluminescence-based enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was developed to measure the kinetics of the WaaP sugar kinase activity, and the results showed that the K(m) was 0.22 mm for ATP and 14.4 microm for hydrofluoric acid-treated LPS, V(max) was 408.24 pmol min(-1), and k(cat) was 27.23 min(-1).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».