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Enregistrement W1979548854 · doi:10.1186/1477-5956-6-2

Development of pan-specific antibody against trimethyllysine for protein research

2008· article· en· W1979548854 sur OpenAlexaff
Zi-Qian Liang, Ronald P.C. Wong, Lin Hong Li, Hesheng Jiang, Hao Xiao, Gang Li

Notice bibliographique

RevueProteome Science · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensVancouver Coastal Health Research InstituteUniversity of British ColumbiaVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteomicsAntibodyChemistryComputational biologyData scienceComputer scienceBiologyImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Trimethylation of the Nepsilon-lysine residues in a protein is one of the most important events of posttranslational modifications. Simple methods for rapid detection and isolation of the Nepsilon-trimethylated protein species are needed. This report introduces a novel method to prepare the affinity purified antibody specific for the Nepsilon-trimethylated lysine (tMeK). The applications of the purified antibody are also reported in this paper. METHODS: We generated the methylated keyhole limpet heomocyanin (KLH) under controlled chemical methylation reaction using CH3I and used it as an immunogen to raise anti-methylated lysine antibodies. The tMeK specific antibody was selectively isolated using a two-step affinity chromatography in which the mMeK/dMeK specific antibodies were removed and the tMeK specific antibody was captured. Finally, the eluted anti-tMeK antibody was characterized. RESULTS: The ELISA results indicated that the antibody reacted only to tMeK but not to mono- and dimethyllysine. Western-blot results showed that the Nepsilon-trimethylated proteins were detected in both animal tissue and cultured cells and that the antibody signal could be competitively inhibited with free tMeK. CONCLUSION: The specific tMeK antibody we developed is useful for one-step isolation of proteins with Nepsilon-trimethyllysine residues and also for the detection, identification and localization of proteins with trimethyllysine residues in the cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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