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Enregistrement W1979661083 · doi:10.1371/journal.pone.0112742

UVC-Induced Stress Granules in Mammalian Cells

2014· article· en· W1979661083 sur OpenAlexafffund
Mohamed Taha Moutaoufik, Rachid El Fatimy, Hassan Nassour, Cristina Gareau, Jérôme Lang, Robert M. Tanguay, Rachid Mazrouï, Édouard W. Khandjian

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésStress granuleCytoplasmCell biologyRNABiologyMolecular biologyPolysomeRNA-binding proteinProtein subunitP-bodiesMessenger RNATranslation (biology)RibosomeBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stress granules (SGs) are well characterized cytoplasmic RNA bodies that form under various stress conditions. We have observed that exposure of mammalian cells in culture to low doses of UVC induces the formation of discrete cytoplasmic RNA granules that were detected by immunofluorescence staining using antibodies to RNA-binding proteins. UVC-induced cytoplasmic granules are not Processing Bodies (P-bodies) and are bone fide SGs as they contain TIA-1, TIA-1/R, Caprin1, FMRP, G3BP1, PABP1, well known markers, and mRNA. Concomitant with the accumulation of the granules in the cytoplasm, cells enter a quiescent state, as they are arrested in G1 phase of the cell cycle in order to repair DNA damages induced by UVC irradiation. This blockage persists as long as the granules are present. A tight correlation between their decay and re-entry into S-phase was observed. However the kinetics of their formation, their low number per cell, their absence of fusion into larger granules, their persistence over 48 hours and their slow decay, all differ from classical SGs induced by arsenite or heat treatment. The induction of these SGs does not correlate with major translation inhibition nor with phosphorylation of the α subunit of eukaryotic translation initiation factor 2 (eIF2α). We propose that a restricted subset of mRNAs coding for proteins implicated in cell cycling are removed from the translational apparatus and are sequestered in a repressed form in SGs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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