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Enregistrement W1979663699 · doi:10.14719/pst.2014.1.4.72

An in silico overview on the usefulness of tags and linkers in plant molecular pharming

2014· article· en· W1979663699 sur OpenAlexaff
Abdullah Makhzoum, Shifa Tahir, Marjorie Elizabeth Osborn Locke, Jocelyne Trémouillaux‐Guiller, Kathleen Hefferon

Notice bibliographique

RevuePlant Science Today · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTransgenic Plants and Applications
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiomanufacturingRecombinant DNAIn silicoBiopharmaceuticalComputational biologyHeterologous expressionBiologyHeterologousBiochemistryProtein engineeringBiotechnologyGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant molecular pharming is a promising concept based on the large-scale production of recombinant proteins encompassing antibodies, vaccines and enzymes for human or veterinary uses and treatments. This new branch of biopharmaceutical industry offers pratcical and safety advantages over other traditional production systems. In higher plants, the complex cellular machinery makes possible synthesis and posttranslational modifications of heterologous protein macromolecules. The limiting obstacle to using this plant system at industrial scale is most often the low yield of the recombinant proteins. To improve this production level, many studies have been focusing on the choice of plant species, tissues, organs and cell suspension cultures or various upstream and downstream constituents in the expression cassettes. Likewise, new engineering technologies in plant molecular pharming have emerged relying on the usefulness of using soybean agglutinin (SBA), hydrophobin, zein and elastin-like peptide tags which are employed to extract and purify recombinant proteins in some host systems and under the control, and as a part, of different expression cassettes. Known to be very useful tools in recombinant proteins linkers separate different domains or units of the heterologous gene and thereby keep the functionality of the protein of interest. Here, we compare computationally one tag SBA as a part of fusion with a pharmaceutical human protein ADA joint directly or by the specific flexible (GGGGS)3 liker. The in silico analysis focuses on the mRNAs stability and fusions of tagged and tagged-linked ADA recombinant proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,198

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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