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Enregistrement W1979673666 · doi:10.1593/tlo.09256

Circulating miR-210 as a Novel Hypoxia Marker in Pancreatic Cancer

2010· article· en· W1979673666 sur OpenAlexaff
Allen S. Ho, Xin Huang, Hongbin Cao, Claudia Christman-Skieller, Kevin L. Bennewith, Quynh‐Thu Le, Albert C. Koong

Notice bibliographique

RevueTranslational Oncology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensOccupational Cancer Research Centre
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésPancreatic cancermicroRNAMedicineBiomarkerInternal medicineCarcinogenesisCancerReverse transcription polymerase chain reactionOncologyCohortCancer researchGastroenterologyPathologyBiologyMessenger RNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNA are small noncoding transcripts involved in many cellular mechanisms, including tumorigenesis. miR-210, in particular, is induced by hypoxia and correlates with adverse outcomes in certain cancers. Because pancreatic adenocarcinomas exhibit extremely hypoxic signatures, we hypothesized that miR-210 may serve as a diagnostic marker for screening or surveillance for pancreatic cancer. Plasma samples were obtained from newly diagnosed pancreatic cancer patients and age-matched noncancer controls. miRNA was extracted directly from plasma and reverse-transcribed to complementary DNA. A known quantity of synthetic Caenorhabditis elegans miR-54 (celmiR-54) was added for normalization. miR-210 and cel-miR-54 were then measured using quantitative reverse transcription polymerase chain reaction. An initial cohort of 11 pancreatic cancer patients and 14 age-matched controls was used as the test set and a second cohort of 11 pancreatic cancer patients and 11 controls was used as the validating set in this study. miR-210 was reliably detected and quantified, with a statistically significant four-fold increase in expression in pancreatic cancer patients compared with normal controls (P < .00004) in the test set. This difference was confirmed in the validation group (P < .018). In summary, circulating miR-210 levels are elevated in pancreatic cancer patients and may potentially serve as a useful biomarker for pancreatic cancer diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations285
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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