<i>TRPM2</i> variants and bipolar disorder risk: confirmation in a family‐based association study
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Recent case-control studies implicate the transient receptor potential melastatin 2 (TRPM2) channel in conferring risk for bipolar disorder (BD), though the risk variants differed. As confounding effects of population structure could not be unequivocally ruled out as the basis for the discordance, we tested the association of TRPM2 with BD in a family design, which is immune to population stratification, for those TRPM2 single nucleotide polymorphisms (SNPs) previously reported as associated with BD. METHODS: The exon 11 SNP (rs1556314) and four informative intronic SNPs (rs1785437, rs1618355, rs933151, and rs749909) were genotyped in 300 BD families by TaqMan allelic discrimination and results were analyzed using chi(2) test, transmission disequilibrium test, and pedigree-based association. SNP rs1556314 was also genotyped in our case-control sample set comprised of 184 BD and 195 healthy Caucasian subjects. RESULTS: The SNP rs1556314 in exon 11 was significantly associated with bipolar disorder type I (BD-I) (p = 0.011, p(permutation) = 0.015) in the case-control dataset and in the family design (p = 0.018, p(permutation) = 0.052, TDTPHASE). Interestingly, the C-T-A haplotype of SNPs rs1618355, rs933151, and rs749909 was significantly associated with early age at onset in BD-I families. CONCLUSION: Significant association of TRPM2 genetic variants with BD in case-control and family datasets further supports a role for TRPM2 in the pathogenesis of this disorder. Overtransmission of the G allele of rs1556314 at exon 11 of TRPM2 in BD-I but not bipolar disorder type II (BD-II) further supports different genetic contributions to the pathogenesis of these bipolar phenotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».