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Enregistrement W1979733583 · doi:10.1103/physreve.73.011909

Single-polymer Brownian motor: A simulation study

2006· article· en· W1979733583 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePhysical Review E · 2006
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
Thématiquestochastic dynamics and bifurcation
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSimon Fraser UniversityNational Science Foundation
Mots-clésBrownian motorPhysicsBrownian motionBrownian dynamicsDragRatchetClassical mechanicsMechanicsStatistical physicsQuantum mechanics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Numerical simulation is used to study a single polymer chain in a flashing ratchet potential to determine how the mechanism of this Brownian motor system is affected by the presence of internal degrees of freedom. The polymer is modeled by a freely jointed chain with N monomers in which the monomers interact via a repulsive Lennard-Jones potential and neighboring monomers on the chain are connected by finite extensible nonlinear elastic bonds. Each monomer is acted upon by a 1D asymmetric, piecewise linear potential of spatial period L comparable to the radius of gyration of the polymer. This potential is also characterized by a localization time, t(on), and by a free diffusion time, t(off). We characterize the average motor velocity as a function of L, t(off), and N to determine optimal parameter ranges, and we evaluate motor performance in terms of finite dispersion, Peclet number, rectification efficiency, stall force, and transportation of a load against a viscous drag. We find that the polymer motor performs qualitatively better than a single particle in a flashing ratchet: with increasing N, the polymer loses velocity much more slowly than expected in the absence of internal degrees of freedom, and the motor stall force increases linearly with N. To understand these cooperative aspects of motor operation, we analyze relevant Rouse modes. The experimental feasibility is analyzed and the parameters of the model are scaled to those of lambda-DNA. Finally, in the context of experimental realization, we present initial modeling results for a 2D flashing ratchet constructed using an electrode array, and find good agreement with the results of 1D simulations although the polymer in the 2D potential sometimes briefly "detaches" from the electrode surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,654
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle