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Enregistrement W1979830686 · doi:10.1073/pnas.1005529108

Phenotypic heterogeneity and instability of human ovarian tumor-initiating cells

2011· article· en· W1979830686 sur OpenAlexafffund
Jocelyn M. Stewart, Patricia A. Shaw, Craig Gedye, Marcus Q. Bernardini, Benjamin G. Neel, Laurie Ailles

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTicsPhenotypeOvarian cancerCancer researchBiologyCell cultureCancerImmunologyGeneticsGeneNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cancer stem cell (CSC) model proposes that tumors have a hierarchical organization in which only some cells indefinitely self-renew and thereby sustain tumor growth. In addition, the CSC model requires that tumor-initiating cells (TICs) be prospectively isolatable on the basis of their phenotype. Previous studies have suggested that serous ovarian cancer (SOC) conforms to the CSC model, but these used arguably nonfidelitous immortalized cell lines, cultured primary cells, or passaged xenografts as the source of tumor cells. We developed a robust assay for quantifying TICs from primary SOC. Using this assay, we find that TICs are rare when assayed in either NOD/SCID or NOD/SCID/IL2Rγ(-/-) (NSG) mice. TIC frequency (TICf) varies substantially between patients, although it is similar in primary ovarian masses and omental metastases, suggesting that TICf is an intrinsic property of ovarian tumors. CD133 marks all TICs from several primary SOC cases. However, in other cases, substantial TIC activity is found in both the CD133(+) and CD133(-) fractions, whereas still other cases have exclusively CD133(-) TICs. Furthermore, the TIC phenotype can change in xenografts: primary tumors in which all TICs are CD133(+) can give rise to xenografts that contain substantial numbers of CD133(-) TICs. Our results highlight the need for quantitative rigor in the evaluation of TICs and for caution when using passaged xenografts for such studies. Furthermore, although our data suggest that SOC conforms to the CSC hypothesis, the heterogeneity of the TIC phenotype may complicate its clinical application.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations210
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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