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Enregistrement W1979896786 · doi:10.1186/ar3994

B-cell receptor signaling studies in patients with lupus: preliminary results

2012· article· en· W1979896786 sur OpenAlexafffund
Michael Faludi, Allen Mao, Évelyne Vinet, Ann E. Clarke, Christian A. Pineau, Sasha Bernatsky, Emil Nashi

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Arthritis NetworkNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesArthritis SocietyLupus Research AllianceArthritis Foundation
Mots-clésRheumatologySystemic lupus erythematosusMedicineInternal medicineReceptorSignal transductionBioinformaticsComputational biologyGeneticsBiologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is significant evidence from murine and human genomic studies that B-cell receptor (BCR) signaling abnormalities are potential factors in the pathogenesis of lupus. However, data on signaling deviations in lupus patients are scant. We have undertaken a project to comprehensively study BCR signaling deviations in lupus patients. Peripheral blood mononuclear cells will be isolated and frozen. B cells will be stimulated with F(ab')2 anti-IgM and anti-IgG. Using eight-parameter flow cytometry, we will determine signaling amplitude, as measured by phosphorylated ERK1/2, in IgG memory cells (CD20 IgG ), mature naïve (CD20 ,CD27 ,CD38 ), transitional (CD20 ,CD38 ,CD10 ), B1 (CD20 ,CD27 ) and IgM memory B cells (CD20 ,IgM ,CD27 ,CD86 ). We will measure pERK levels at baseline (time 0), 1 minute (early signal), 5 minutes (peak signal) and 15 minutes (late signal). We will establish normal parameters by studying BCR signaling in 100 nonautoimmune individuals. We will then determine the prevalence of low and high BCR signaling deviations in 100 lupus patients. Signaling deviations will be correlated with clinical data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,752
Score d'incertitude au seuil0,813

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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