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Enregistrement W1979964258 · doi:10.1002/cyto.b.21111

Use of CD157 in FLAER-based assays for high-sensitivity PNH granulocyte and PNH monocyte detection

2013· article· en· W1979964258 sur OpenAlexaff
D. Robert Sutherland, Erica Acton, Michael Keeney, Bruce H. Davis, Andrea Illingworth

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueComplement system in diseases
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCD64MonocyteGranulocytePredicate (mathematical logic)AutoAnalyzerImmunologyAnalyteMedicineChemistryFlow cytometryInternal medicineComputer scienceChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recent Flow Cytometric guidelines to detect Paroxysmal Nocturnal Hemoglobinuria (PNH) in white blood cells recommend using FLAER-based assays to detect granulocytes and monocytes lacking expression of GPI-linked structures. However national proficiency testing results continue to suggest a need for improved testing algorithms, including the need to optimize diagnostic analytes in PNH. METHODS: CD157 is another GPI-linked structure expressed on both granulocytes and monocytes and here we assess its ability to replace CD24 and CD14 in predicate 4-color granulocyte and monocyte assays respectively. We also assess a single tube, 5-color combination of FLAER, CD157, CD64, CD15, and CD45 to simultaneously detect PNH clones in granulocyte and monocyte lineages. RESULTS: Delineation of PNH from normal phenotypes with 4- or 5-color CD157-based assays compared favorably with 4-color predicate methods and PNH clone size data were similar and highly correlated (R(2) >0.99) with predicate values over a range (0.06%-99.8%) of samples. Both CD157-based assays exhibited similar high levels of sensitivity and low background levels in normal samples. CONCLUSIONS: While CD157-based 4- and 5-color assays generated closely similar results to the predicate assays on a range of PNH and normal samples, the 5-color assay has significant advantages. Only a single 5-color WBC reagent cocktail is required to detect both PNH granulocytes and monocytes. Additionally, sample preparation and analysis time is reduced yielding significant efficiencies in technical resources and reagent costs. All 4- and 5-color reagent sets stained stabilized whole blood PNH preparations, used in external quality assurance programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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