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Enregistrement W1979981074 · doi:10.1139/g03-147

Analysis of phylogenetic relationship among five mulberry (<i>Morus</i>) species using molecular markers

2004· article· en· W1979981074 sur OpenAlexvenueno aff
K. Vijayan, Prem Prakash Srivastava, A. K. Awasthi

Notice bibliographique

RevueGenome · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSilkworms and Sericulture Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRAPDBiologySubspeciesLoss of heterozygosityGene flowPhylogenetic treeGenetic markerMolecular markerPopulationGenotypeBotanyGenetic variationGeneticsGenetic diversityZoologyGeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Species identification in mulberry (Morus) continues to be a point of great debate among scientists despite the number of criteria such as floral characters, wood, and leaf anatomical and biochemical characters used to identify the species within this genus. However, no consensus system of classification has emerged. Hence, an investigation was undertaken with inter-simple sequence repeat (ISSR) and random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers to find out the possibility of using these DNA markers to confirm the identity of genotypes in a particular species. Fifteen ISSR and 15 RAPD primers generated 86% and 78% polymorphism, respectively, among 19 mulberry genotypes. The polymorphism among the species varied from 50% to 57% in ISSR markers and 31% to 53% in RAPD markers. Similarity coefficients were higher among the genotypes of M. latifolia, M. bombycis and M. alba. Cluster analyses separated genotypes of M. laevigata and M. indica from those of the other species. Population structure analysis of these species further showed high genetic differentiation coefficients (GST), high heterozygosity between two species (DST), and total heterozygosity among populations (Ht) coupled with considerably low gene flow (Nm) when M. laevigata was paired with other species. Based on these parameters and the result of cluster analysis it is concluded that M. laevigata can be considered as a separate species of mulberry, whereas the other four species may be grouped together and treated as subspecies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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