Viral Quantitative Capillary Electrophoresis for Counting Intact Viruses
Notice bibliographique
Résumé
The quantification of a virus plays an important role in vaccine development, clinical diagnostics, and environmental contamination assays. In all these cases, it is essential to calculate the concentration or number of intact virus particles (ivp) and estimate the degree of degradation and contamination of virus samples. In this work, we propose a cost-efficient, robust method for the quantification and characterization of intact viruses based on capillary zone electrophoresis. This separation method is demonstrated on vaccinia virus (VV) with oncolytic properties. After virus sample preparation, the solution contains intact VV as well as broken viruses and residual DNA from the host cell used for preparation. Regulatory requirements limit the amount of the host cell DNA that can be present in vaccines or human therapeutics. We apply capillary electrophoresis to separate intact virus particles and the residual DNA and to measure the level of virus contamination with DNA impurities. Intercalating YOYO-1 dye is used to detect the encapsulated and free DNA by laser-induced fluorescence. After soft lysis of VV with proteinase K, all encapsulated DNA is dissolved to the free DNA. The change in peak areas and a DNA calibration curve help determine the initial concentration of intact viruses. This viral quantitative capillary electrophoresis (Viral qCE) is able to quantify the oncolytic vaccinia virus in the range of 10(6) to 10(12) ivp/mL.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».