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Enregistrement W1980141808 · doi:10.1016/j.crohns.2012.04.014

Causality in administrative datasets

2012· letter· en· W1980141808 sur OpenAlexaff
Julia McNabb‐Baltar, Quoc‐Dien Trinh

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2012
Typeletter
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueHealthcare cost, quality, practices
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCausality (physics)MedicineInflammatory Bowel DiseasesIntensive care medicinePediatricsInflammatory bowel diseaseInternal medicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dear Sir, We read with great interest the original contribution by Ananthakrishnan et al. on the effect of infection-related hospitalizations in patients with inflammatory bowel diseases on mortality, hospital stay and hospital charges.1 The authors conclude fittingly that infections account for significant morbidity and mortality in these patients and identify several risk factors of infectious events. We congratulate the authors for addressing this important topic, and laud their efforts to identify important patient characteristics, namely age and Elixhauser co-morbidity score,2 that are strongly correlated with infections in hospitalized IBD patients. Nonetheless, we would like to highlight two points that merit further discussion. First, although the investigators attempted to identify patient characteristics associated with infection-related hospitalizations, they missed an opportunity to examine the effect of several key structural determinants. Specifically, the impact of demographic characteristics, including insurance3 and median zip code income4 as surrogates for socioeconomic status, was not examined. Moreover, it would also have been interesting to document the impact of provider volume on the risk of infection-related hospitalization. Finally, hospital attributes, such as hospital bed size and location (rural vs. urban) were not examined, even though these variables are readily available in the Nationwide Inpatient Sample. Second, as the authors justifiably point out, the administrative claims-based nature of the Nationwide Inpatient Sample precludes the authors from concluding about causation. As such, reasonable doubt can be raised with regard to several of their key findings. For example, the authors highlight that 15% of sepsis occurred in patients requiring total parenteral nutrition (TPN). Therefore, the authors conclude that minimizing the need for such indwelling catheters would reduce the risk of such catheter-related infections. Yet, it is entirely possible that patients presenting with severe sepsis (and other subsequent acute-phase events) required TPN at some point during hospitalization. The same could be said about hospital stay: does infection lead to a prolonged stay or does a prolonged stay put a patient at risk for infection? Therefore, due to a lack of a clear chronology of diagnostic codes in this dataset (unlike procedure codes, which can be determined using the variable “PRDAYn”), the findings of this study need to be interpreted with caution. Indeed, is it the chicken or the egg?

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,048
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,395
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,952
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0480,395
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,009
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0080,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,565
Tête enseignante GPT0,560
Écart entre enseignants0,005 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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