Stability of the homopentameric b subunits of shiga toxins 1 and 2 in solution and the gas phase as revealed by nanoelectrospray fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
The assembly of the B subunits of Shiga toxins (Stx) 1 and 2 and the influence of solution conditions (protein concentration, temperature, pH, and ionic strength) on it are investigated using temperature-controlled nanoflow electrospray (nano-ES) ionization and Fourier-transform ion cyclotron resonance mass spectrometry. Despite the similar higher order structure predicted by X-ray crystallography analysis, the B(5) homopentamers of Stx1 and Stx2 exhibit differences in stability under the solution conditions investigated. At solution temperatures ranging from 0 to 60 degrees C and subunit concentrations ranging from 5 to 85 microM, the Stx1 B subunit exists almost entirely as the homopentamer in aqueous solutions, independent of the ionic strength. In contrast, the degree of assembly of Stx2 B subunit is strongly dependent on temperature, subunit concentration, and ionic strength. At subunit concentrations of more than 50 microM, the Stx2 B subunit exists predominantly as a pentamer, although smaller multimers (dimer, trimer, and tetramer) are also evident. At lower concentrations, the Stx2 B subunit exists predominantly as monomer and dimer. The relative abundance of multimeric species of the Stx2 B subunit was insensitive to the ion source conditions, suggesting that gas-phase dissociation of the pentamer ions in the source does not influence the mass spectrum. Blackbody infrared radiative dissociation of the protonated B(5) ions of Stx2 at the +12 and +13 charge states proceeds, at reaction temperatures of 120 to 180 degrees C, predominantly by the ejection of a single subunit from the complex. Dissociation into dimer and trimer ions constitutes a minor pathway. It follows that the dimer and trimer ions and, likely, the monomer ions observed in the nano-ES mass spectra of Stx2 B subunit originated in solution and not from gas-phase reactions. It is concluded that, under the solution conditions investigated, the homopentamer of Stx2 B subunit is thermodynamically less stable than that of Stx1 B subunit. Arrhenius activation parameters determined for the protonated Stx2 B(5) ions at the +12 and +13 charge states were compared with values reported for the corresponding B(5) ions of Stx1 B subunit. In contrast to the differential stability of the Stx1 and Stx2 B pentamers in solution, the dissociation activation energies (E(a)) determined for the gaseous complexes are indistinguishable at a given charge state. The similarity in the E(a) values suggests that the protonated pentamer ions of both toxins are stabilized by similar intersubunit interactions in the gas phase, a result that is in agreement with the X-ray crystal structures of the holotoxins.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».