Physical and genetic map of the <i>Spiroplasma kunkelii</i> CR2-3x chromosome
Notice bibliographique
Résumé
Spiroplasma kunkelii (class Mollicutes) is the characteristically helical, wall-less bacterium that causes corn stunt disease. A combination of restriction enzyme analysis, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), and Southern hybridization analysis was used to construct a physical and genetic map of the S. kunkelii CR2-3x chromosome. The order of restriction fragments on the map was determined by analyses of reciprocal endonuclease double digests employing I-CeuI, AscI, ApaI, EagI, SmaI, BssHII, BglI, and SalI; adjacent fragments were identified on two-dimensional pulsed-field electrophoresis gels. The size of the chromosome was estimated at 1550 kb. Oligonucleotide pairs were designed to prime the amplification of 26 S. kunkelii gene sequences in the polymerase chain reaction (PCR). Using PCR amplicons as probes, the locations of 27 S. kunkelii putative single-copy genes were positioned on the map by Southern hybridization analyses of chromosomal fragments separated in PFGE. The nucleotide sequence of the single ribosomal RNA operon was determined and its location mapped to a chromosomal segment bearing recognition sites for SalI, SmaI, EagI, and I-CeuI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».