The development of a bin mapping population and the selective mapping of 103 markers in the diploid<i>Fragaria</i>reference map
Notice bibliographique
Résumé
We have identified a set of plants (the bin set) to permit "selective" or "bin" mapping using the diploid strawberry mapping population FV x FN, derived from the F2 cross F. vesca 815 x F. nubicola 601, which has been used to develop the Fragaria reference map. The bin set consists of 8 plants: the F. vesca 815 parent, the F1 hybrid individual, and 6 seedlings of the F2 population. This bin set divides the 578 cM of the diploid Fragaria genome into 46 bins, the largest mapping bin being 26 cM in length and the average bin size being 12.6 cM. To validate the FV x FN bin set, we used it to locate 103 loci into bins on the FV x FN map. These loci comprised 61 previously described SSRs, 38 new SSRs developed in this investigation from Fragaria x ananassa genomic DNA, EST and gene sequences, and 4 ripening-related genes developed for Prunus. The 103 markers were located to bins on all 7 linkage groups of the Fragaria map and a new mapping bin was identified with the novel markers, demonstrating that the map covers the majority of the diploid Fragaria genome and that the 6 bin-set seedlings selected were appropriate for bin mapping using this progeny.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».