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Enregistrement W1980265302 · doi:10.1167/iovs.03-0908

Expression of the α4 Integrin Subunit Gene Promoter Is Modulated by the Transcription Factor Pax-6 in Corneal Epithelial Cells

2004· article· en· W1980265302 sur OpenAlexaff
Karine Zaniolo, Steeve Leclerc, Aleš Cvekl, Luc Vallières, Richard Bazin, Kathy Larouche, Sylvain L. Gue ́rin

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesNational Eye Institute
Mots-clésMolecular biologyBiologyTranscription factorProtein subunitIntegrinCorneal epitheliumGene expressionPromoterIntegrin, beta 6FibronectinTranscription (linguistics)GeneCell biologyIntegrin alpha MReceptorEpitheliumFlow cytometryExtracellular matrixGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Expression of several membrane-bound integrins is thought to be altered during corneal wound healing as a consequence of the massive secretion of fibronectin occurring during this process. Examination of the alpha4 integrin subunit gene promoter revealed the presence of three putative binding sites for the transcription factor Pax-6 expressed in the basal cells of the corneal epithelium during corneal wound healing. This study was undertaken to investigate whether the alpha4 integrin subunit is expressed in primary cultures of rabbit corneal epithelial cells (RCECs) and to test whether Pax-6 binds the alpha4 gene promoter and regulates its transcriptional activity. METHODS: Both flow cytometry and immunocytochemical analyses, along with an antibody-directed receptor interference assay, were used to examine expression of the alpha4 subunit in RCECs. Expression of Pax6 was investigated by immunoblot analysis. Binding of PAX6 to the alpha4 gene promoter was tested in electrophoretic mobility shift assays (EMSAs). The regulatory influence exerted by Pax6 on the alpha4 promoter was studied by transfections in RCECs. RESULTS: Expression of alpha4 was detected at both the mRNA and protein levels. Pax-6 was expressed in a cell-density-dependent manner in RCECs and altered the activity of the alpha4 promoter by interacting with multiple sites in both the promoter and 5'-flanking sequences. Pax-6 was also identified as the major protein component from the Bp5 complex, one of five protein complexes reported to bind the alpha4.1 element from the alpha4 basal promoter in vitro. CONCLUSIONS: These results provide evidence that the integrin subunit alpha4 and Pax-6 are coexpressed in RCECs and raise the possibility that Pax-6 directly regulates the expression of the alpha4 gene during corneal wound healing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,005
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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