Positional importance of Pro53 adjacent to the Arg49-Gly50-Asp51 sequence of rhodostomin in binding to integrin αIIbβ3
Notice bibliographique
Résumé
Rhodostomin (RHO), a disintegrin isolated from snake venom, has been demonstrated to inhibit platelet aggregation through interaction with integrin alphaIIbbeta3, but there is a lack of direct evidence for RHO-integrin alphaIIbbeta3 binding. In addition, no study on the length of Arg(49)-Gly(50)-Asp(51) (RGD) loop of RHO influencing on its binding to integrin alphaIIbbeta3 has been reported. In the present study we have developed a highly sensitive dot-blot and glutathione S-transferase-RHO pull-down assays; the latter was coupled with a biotin-avidin-horseradish peroxidase enhanced-chemiluminescence detection system. These were able to demonstrate the direct binding of RHO to integrin alphaIIbbeta3. The pull-down assay further showed that four alanine-insertion mutants upstream of the RGD motif and three insertions downstream of the RGD were able to decrease integrin alphaIIbbeta3 binding activity to only a limited extent. By contrast, two insertions immediately next to RGD and one insertion in front of the Cys(57) caused almost complete loss of binding activity to alphaIIbbeta3. The results of the platelet-aggregation-inhibition assay and platelet-adhesion assay for the insertion mutants were consistent with results of the pull-down assay. It is thus concluded that, although an insertion of a single alanine residue in many positions of the RGD loop has only minor effects on RHO binding to integrin alphaIIbbeta3, the specific position of Pro(53) residue adjacent to the RGD sequence is important for RHO binding to platelet integrin alphaIIbbeta3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».