Identification of a novel motif that affects the conformation and activity of the MARCH1 E3 ubiquitin ligase
Notice bibliographique
Résumé
MARCH1, a member of the membrane-associated RING-CH family of E3 ubiquitin ligases, regulates antigen presentation by downregulating the cell surface expression of Major Histocompatibility Complex class II and CD86 molecules. MARCH1 is a transmembrane protein that exposes both its N- and C-terminus to the cytoplasm. We have conducted a structure-function analysis of its two cytoplasmic tails to gain insights into the trafficking of MARCH1 in the endocytic pathway. Fusion of the N-terminal portion of MARCH1 to a type II transmembrane reporter molecule revealed that this cytoplasmic tail contains endosomal sorting motifs. The C-terminal domain also appears to contain intracellular sorting signals because it reduced surface expression of a type I transmembrane reporter molecule. Mutation of the two putative C-terminal tyrosine-based sorting signals did not affect the activity of human MARCH1; however, it did reduce its incorporation into exosomes. Moreover, site-directed mutagenesis pointed to a functional C-terminal 221VQNC224 sequence that affects the spatial organization of the two cytoplasmic regions. This motif is also found in other RING-type E3 ubiquitin ligases, such as parkin. Altogether, these findings highlight the complex regulation of MARCH1 trafficking in the endocytic pathway as well as the intricate interactions between its cytoplasmic tails.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».