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Enregistrement W1980512687 · doi:10.1002/jcb.22335

A cell‐based Dkk1 binding assay reveals roles for extracellular domains of LRP5 in Dkk1 interaction and highlights differences between wild‐type and the high bone mass mutant LRP5(G171V)

2009· article· en· W1980512687 sur OpenAlexaff
Richard J. Murrills, Jeanne J. Matteo, Bheem M. Bhat, Valerie E. Coleburn, Kristina M. Allen, Wei Chen, Véronique Damagnez, Ramesh A. Bhat, Frederick J. Bex, Peter V.N. Bodine

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensWomen's Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDKK1LRP5TransfectionWnt signaling pathwayMutantCell biologyChemistryExtracellularReceptorBinding domainMolecular biologyBiologyBiochemistryBinding siteSignal transductionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dkk1 is a secreted antagonist of the LRP5-mediated Wnt signaling pathway that plays a pivotal role in bone biology. Because there are no well-documented LRP5-based assays of Dkk1 binding, we developed a cell-based assay of Dkk1/LRP5 binding using radioactive (125)I-Dkk1. In contrast to LRP6, transfection of LRP5 alone into 293A cells resulted in a low level of specific binding that was unsuitable for routine assay. However, co-transfection of LRP5 with the chaperone protein MesD (which itself does not bind Dkk1) or Kremen-2 (a known Dkk1 receptor), or both, resulted in a marked enhancement of specific binding that was sufficient for evaluation of Dkk1 antagonists. LRP5 fragments comprising the third and fourth beta-propellers plus the ligand binding domain, or the first beta-propeller, each inhibited Dkk1 binding, with mean IC(50)s of 10 and 196 nM, respectively. The extracellular domain of Kremen-2 ("soluble Kremen") was a weaker antagonist (mean IC(50) 806 nM). We also found that cells transfected with a high bone mass mutation LRP5(G171V) had a subtly reduced level of Dkk1 binding, compared to wild type LRP5-transfected cells, and no enhancement of binding by MesD. We conclude that (1) LRP5-transfected cells do not offer a suitable cell-based Dkk1 binding assay, unless co-transfected with either MesD, Kremen-2, or both; (2) soluble fragments of LRP5 containing either the third and fourth beta-propellers plus the ligand binding domain, or the first beta-propeller, antagonize Dkk1 binding; and (3) a high bone mass mutant LRP5(G171V), has subtly reduced Dkk1 binding, and, in contrast to LRP5, no enhancement of binding with MesD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,724

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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