MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1980516906 · doi:10.1371/journal.pone.0042636

Dysregulation of Autophagy in Murine Fibroblasts Resistant to HSV-1 Infection

2012· article· en· W1980516906 sur OpenAlexafffund
Valerie Le Sage, Bruce W. Banfield

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchDalhousie UniversityNorthwestern University
Mots-clésAutophagyAutophagosomeBiologyCytoplasmCell biologyOrganelleProgrammed cell deathHerpes simplex virusCell cultureCellVirusVirologyApoptosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mouse L cell mutant, gro29, was selected for its ability to survive infection by herpes simplex virus type 1 (HSV-1). gro29 cells are fully susceptible to HSV-1 infection, however, they produce 2000-fold less infectious virus than parental L cells despite their capacity to synthesize late viral gene products and assemble virions. Because productive HSV-1 infection is presumed to result in the death of the host cell, we questioned how gro29 cells might survive infection. Using time-lapse video microscopy, we demonstrated that a fraction of infected gro29 cells survived infection and divided. Electron microscopy of infected gro29 cells, revealed large membranous vesicles that contained virions as well as cytoplasmic constituents. These structures were reminiscent of autophagosomes. Autophagy is an ancient cellular process that, under nutrient deprivation conditions, results in the degradation and catabolism of cytoplasmic components and organelles. We hypothesized that enhanced autophagy, and resultant degradation of virions, might explain the ability of gro29 to survive HSV-1 infection. Here we demonstrate that gro29 cells have enhanced basal autophagy as compared to parental L cells. Moreover, treatment of gro29 cells with 3-methyladenine, an inhibitor of autophagy, failed to prevent the formation of autophagosome-like organelles in gro29 cells indicating that autophagy was dysregulated in these cells. Additionally, we observed robust co-localization of the virion structural component, VP26, with the autophagosomal marker, GFP-LC3, in infected gro29 cells that was not seen in infected parental L cells. Collectively, these data support a model whereby gro29 cells prevent the release of infectious virus by directing intracellular virions to an autophagosome-like compartment. Importantly, induction of autophagy in parental L cells did not prevent HSV-1 production, indicating that the relationship between autophagy, virus replication, and survival of HSV-1 infection by gro29 cells is complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetAutophagy in Disease and TherapyTravaux en français237 207