Characteristics of Clinical Shiga Toxin-Producing<i>Escherichia coli</i>Isolated from British Columbia
Notice bibliographique
Résumé
Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) are significant public health threats. Although STEC O157 are recognized foodborne pathogens, non-O157 STEC are also important causes of human disease. We characterized 10 O157:H7 and 15 non-O157 clinical STEC derived from British Columbia (BC). Eae, hlyA, and stx were more frequently observed in STEC O157, and 80 and 100% of isolates possessed stx₁ and stx₂, respectively. In contrast, stx₁ and stx₂ occurred in 80 and 40% of non-O157 STEC, respectively. Comparative genomic fingerprinting (CGF) revealed three distinct clusters (C). STEC O157 was identified as lineage I (LI; LSPA-6 111111) and clustered as a single group (C1). The cdi gene previously observed only in LII was seen in two LI O157 isolates. CGF C2 strains consisted of diverse non-O157 STEC while C3 included only O103:H25, O118, and O165 serogroup isolates. With the exception of O121 and O165 isolates which were similar in virulence gene complement to STEC O157, C1 O157 STEC produced more Stx2 than non-O157 STEC. Antimicrobial resistance (AMR) screening revealed resistance or reduced sensitivity in all strains, with higher levels occurring in non-O157 STEC. One STEC O157 isolate possessed a mobile bla(CMY-2) gene transferrable across genre via conjugation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».