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Enregistrement W1980754306 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-11-0127

Genetic Aberrations Leading to MAPK Pathway Activation Mediate Oncogene-Induced Senescence in Sporadic Pilocytic Astrocytomas

2011· article· en· W1980754306 sur OpenAlexafffund
Karine Jacob, Dongh-Anh Quang-Khuong, David Jones, Hendrik Witt, S. Lambert, Steffen Albrecht, Olaf Witt, Catherine Vézina, Margret Shirinian, Damien Faury, Miklós Garami, Peter C. Hauser, Álmos Klekner, László Bognár, Jean‐Pierre Farmer, Jose-Luis Montes, Jeffrey Atkinson, Cynthia Hawkins, Andrey Korshunov, V. Peter Collins, Stefan M. Pfister, Uri Tabori, Nada Jabado

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversitySickKids FoundationHospital for Sick ChildrenMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHungarian Scientific Research FundBrain Tumour Charity
Mots-clésSenescenceCancer researchMAPK/ERK pathwayBiologyPilocytic astrocytomaGeneticsMedicineSignal transductionAstrocytomaGlioma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Oncogenic BRAF/Ras or NF1 loss can potentially trigger oncogene-induced senescence (OIS) through activation of the mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway. Somatic genetic abnormalities affecting this pathway occur in the majority of pilocytic astrocytomas (PA), the most prevalent brain neoplasm in children. We investigated whether OIS is induced in PA. EXPERIMENTAL DESIGN: We tested expression of established senescence markers in three independent cohorts of sporadic PA. We also assessed for OIS in vitro, using forced expression of wild-type and V600E-mutant BRAF in two astrocytic cell lines: human telomerase reverse transcriptase (hTERT)-immortalized astrocytes and fetal astrocytes. RESULTS: Our results indicate that PAs are senescent as evidenced by marked senescence-associated acidic β-galactosidase activity, low KI-67 index, and induction of p16(INK4a) but not p53 in the majority of 52 PA samples (46 of 52; 88.5%). Overexpression of a number of senescence-associated genes [CDKN2A (p16), CDKN1A (p21), CEBPB, GADD45A, and IGFBP7] was shown at the mRNA level in two independent PA tumor series. In vitro, sustained activation of wild-type or mutant BRAF induced OIS in both astrocytic cell lines. Loss of p16(INK4a) in immortalized astrocytes abrogated OIS, indicative of the role of this pathway in mediating this phenomenon in astrocytes. OIS is a mechanism of tumor suppression that restricts the progression of benign tumors. We show that it is triggered in PAs through p16(INK4a) pathway induction following aberrant MAPK activation. CONCLUSIONS: OIS may account for the slow growth pattern in PA, the lack of progression to higher-grade astrocytomas, and the high overall survival of affected patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,563

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,451
Tête enseignante GPT0,516
Écart entre enseignants0,065 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations174
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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