Characterization of YpmQ, an Accessory Protein Required for the Expression of Cytochrome c Oxidase in Bacillus subtilis
Notice bibliographique
Résumé
A search of the Bacillus subtilis genome identifies a potential homolog, ypmQ, of the inner mitochondrial membrane protein Sco1 from yeast. Sco1 has been found to aid the delivery of copper to cytochrome c oxidase. B. subtilis expresses two members of the cytochrome oxidase family, a cytochrome c oxidase that has two copper centers, Cu(A) and Cu(B), and a menaquinol oxidase that has only Cu(B). Deletion of ypmQ in B. subtilis depresses expression of cytochrome c oxidase but not menaquinol oxidase. Levels of cytochrome c oxidase recover when copper is added to the growth medium of the DeltaypmQ strain or when ypmQ is expressed from a plasmid. Neither treatment affects the amount or activity of menaquinol oxidase. YpmQ in which two conserved cysteines are replaced by serines and a conserved histidine is replaced by alanine do not complement the deletion of ypmQ even though these mutant forms are found in the membrane extract at a level similar to the wild type protein. We propose that the two cysteines and the histidine are critical for the function of YpmQ and suggest they are involved in copper exchange between YpmQ and the Cu(A) site of cytochrome c oxidase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».