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Enregistrement W1980866663 · doi:10.1002/gcc.20649

Increased genomic instability and altered chromosomal protein phosphorylation timing in <i>HRAS</i>‐transformed mouse fibroblasts

2009· article· en· W1980866663 sur OpenAlexaff
Katherine Dunn, Shihua He, Landon Wark, Geneviève P. Delcuve, Jianmin Sun, Hou Yu Chen, Sabine Mai, James Davie

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHRASGenome instabilityChromosome instabilityPhosphorylationCell biologyInstabilityBiologyCancer researchGeneticsMolecular biologyMutationDNAGeneChromosomePhysicsDNA damage

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The RAS-mitogen-activated protein kinase signaling pathway is often deregulated in cancer cells. In metastatic HRAS-transformed mouse fibroblasts (Ciras-3), the RAS-MAPK pathway is constitutively activated. We show here that Ciras-3 cells exhibit a higher incidence of chromosomal instability than 10T1/2 cells, including higher levels of clonal and nonclonal chromosomal aberrations. Stimulation of serum starved 10T1/2 and Ciras-3 cells with phorbol esters (TPA) results in the phosphorylation of histone H3 at serine 10 and serine 28. Regardless of the increased genomic instability in Ciras-3 cells, TPA-induced H3 phosphorylated at serine 10 and H3 phosphorylated at serine 28 partitioned into distinct nuclear subdomains as they did in the parental cells. However, the timing of the response of the H3 phosphorylation event to TPA induction was delayed in Ciras-3 cells. Further Ciras-3 cells, which have a more open chromatin structure, had increased steady state levels of phosphorylated H3 and HMGN1 relative to parental 10T1/2 cells. TPA-induced H3 phosphorylated at serine 10 and 28 were colocalized with the transcriptionally initiated form of RNA polymerase II in 10T1/2 and Ciras-3 cells. Chromatin immunoprecipitation assays demonstrated that TPA-induced H3 phosphorylation at serine 28 was associated with the immediate early JUN promoter, providing direct evidence that this histone post-translational modification is associated with transcriptionally active genes. Together our results demonstrate the increased genomic instability and alterations in the epigenetic program in HRAS-transformed cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,841

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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