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Enregistrement W1980889351 · doi:10.1371/journal.pone.0090335

Maternal Nutrition Induces Pervasive Gene Expression Changes but No Detectable DNA Methylation Differences in the Liver of Adult Offspring

2014· article· en· W1980889351 sur OpenAlexfundno aff
Matthew V. Cannon, David A. Buchner, Hadley Miller, Ephraim Sehayek, Joseph H. Nadeau, David Serre

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Chronic Disease Prevention and Health PromotionMcGill UniversityNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Center for Research ResourcesNational Institutes of HealthCase Western Reserve University
Mots-clésOffspringDNA methylationBiologyGene expressionEpigeneticsGeneGeneticsMethylationRegulation of gene expressionPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Epidemiological and animal studies have shown that maternal diet can influence metabolism in adult offspring. However, the molecular mechanisms underlying these changes remain poorly understood. Here, we characterize the phenotypes induced by maternal obesity in a mouse model and examine gene expression and epigenetic changes induced by maternal diet in adult offspring. METHODS: We analyzed genetically identical male mice born from dams fed a high- or low-fat diet throughout pregnancy and until day 21 postpartum. After weaning, half of the males of each group were fed a high-fat diet, the other half a low-fat diet. We first characterized the genome-wide gene expression patterns of six tissues of adult offspring - liver, pancreas, white adipose, brain, muscle and heart. We then measured DNA methylation patterns in liver at selected loci and throughout the genome. RESULTS: Maternal diet had a significant effect on the body weight of the offspring when they were fed an obesogenic diet after weaning. Our analyses showed that maternal diet had a pervasive effect on gene expression, with a pronounced effect in liver where it affected many genes involved in inflammation, cholesterol synthesis and RXR activation. We did not detect any effect of the maternal diet on DNA methylation in the liver. CONCLUSIONS: Overall, our findings highlighted the persistent influence of maternal diet on adult tissue regulation and suggested that the transcriptional changes were unlikely to be caused by DNA methylation differences in adult liver.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,273
Score d'incertitude au seuil0,240

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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