MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1980935574 · doi:10.1158/1538-7445.am10-lb-147

Abstract LB-147: Characterization of a Kaiso overexpressing transgenic mouse model

2010· article· en· W1980935574 sur OpenAlexaff
Roopali Chaudhary, Kyster K. Nanan, Juliet M. Daniel

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensQueen's UniversityMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayCell biologyTranscription factorBiologyCarcinogenesisCancer researchSignal transductionCancerGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: The WNT signaling pathway plays critical roles during embryogenesis and maintaining homeostasis of adult tissues. However constitutive WNT signaling leads to tumorigenesis. Upon activation of the WNT pathway, the main downstream effector of the WNT pathway, ß-catenin, stabilizes and translocates to the nucleus where it activates transcription of WNT target genes. Recently, our lab along with others identified the novel transcription factor Kaiso as a negative regulator of WNT target genes in mammalian cell lines and Xenopus models. However a study using a Kaiso depleted mouse model implicated Kaiso as a positive regulator of WNT signaling. Kaiso is a member of the BTB/POZ (broad-complex, tramtrack and bric-à-brac/poxvirus and zinc finger) protein family. The goal of this study is to elucidate the role of Kaiso in WNT signaling using the ApcMin/+ mouse model of intestinal cancer. Methodology: To assess the role of Kaiso in colon cancer in vivo, Kaiso overexpressing transgenic mice were created (KaisoTg). Targeted overexpression of Kaiso in KaisoTg mice was obtained by pronuclear injection of Kaiso cDNA under the control of the intestine-specific villin promoter. Reverse transcription PCR (RT-PCR) and Western Blot analyses were used to determine tissue specific Kaiso overexpression in KaisoTg mice. Immunohistochemisty (IHC) was performed on mouse intestinal tissues to examine the subcellular localization of Kaiso and assess developmental defects. KaisoTg mice were then mated with APCMin/+ mice models of intestinal cancer that develop polyps in the small intestine due to constitutively active -catenin. KaisoTg-APCMin/+ mice were examined for gross morphological phenotypes and IHC was performed on mouse intestinal tissues for Kaiso and other WNT target genes (e.g. cyclin D1) to elucidate the effects of Kaiso on the WNT pathway. Results: Western Blot analysis revealed high, moderate and low levels of Kaiso overexpression in three founder lines of the KaisoTg mice. RT-PCR analysis showed Kaiso overexpression limited to villin positive tissues including kidney, small and large intestines. IHC analysis of KaisoTg tissues showed no gross morphological differences compared to non-transgenic mice. However KaisoTg-APCMin/+ displayed decreased body size and weight, and had decreased life span when compared to the parentals (i.e. KaisoTg and APCmin/+). IHC analysis of KaisoTg-APCMin/+ mouse intestines revealed increased polyp numbers with Kaiso staining concentrated near the basal surface of the polyps. These data support Kaiso's potential role as an oncogene in mouse intestinal tissues. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr LB-147.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207