Processive ATP-driven Substrate Disassembly by the N-Ethylmaleimide-sensitive Factor (NSF) Molecular Machine
Notice bibliographique
Résumé
SNARE proteins promote membrane fusion by forming a four-stranded parallel helical bundle that brings the membranes into close proximity. Post-fusion, the complex is disassembled by an AAA+ ATPase called N-ethylmaleimide-sensitive factor (NSF). We present evidence that NSF uses a processive unwinding mechanism to disassemble SNARE proteins. Using a real-time disassembly assay based on fluorescence dequenching, we correlate NSF-driven disassembly rates with the SNARE-activated ATPase activity of NSF. Neuronal SNAREs activate the ATPase rate of NSF by ∼26-fold. One SNARE complex takes an average of ∼5 s to disassemble in a process that consumes ∼50 ATP. Investigations of substrate requirements show that NSF is capable of disassembling a truncated SNARE substrate consisting of only the core SNARE domain, but not an unrelated four-stranded coiled-coil. NSF can also disassemble an engineered double-length SNARE complex, suggesting a processive unwinding mechanism. We further investigated processivity using single-turnover experiments, which show that SNAREs can be unwound in a single encounter with NSF. We propose a processive helicase-like mechanism for NSF in which ∼1 residue is unwound for every hydrolyzed ATP molecule.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».