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Enregistrement W1981006148 · doi:10.1074/jbc.m407827200

The Minimal Essential Unit for Cadherin-mediated Intercellular Adhesion Comprises Extracellular Domains 1 and 2

2004· article· en· W1981006148 sur OpenAlexaff
Weisong Shan, Yoshiki Yagita, Zhaohui Wang, Alexander Koch, Åsa Fex Svenningsen, Eugenia Gruzglin, Liliana Pedraza, David Colman

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of Health
Mots-clésCadherinExtracellularCell biologyAdhesionCell adhesionIntracellularCytoplasmChemistryCellBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

N-cadherin comprises five homologous extracellular domains, a transmembrane, and a cytoplasmic domain. The extracellular domains of N-cadherin play important roles in homophilic cell adhesion, but the contribution of each domain to this phenomenon has not been fully evaluated. In particular, the following questions remain unanswered: what is the minimal domain combination that can generate cell adhesion, how is domain organization related to adhesive strength, and does the cytoplasmic domain serve to facilitate extracellular domain interaction? To address these issues, we made serial constructs of the extracellular domains of N-cadherin and produced various cell lines to examine adhesion properties. We show that the first domain of N-cadherin alone on the cell surface fails to generate adhesive activity and that the first two domains of N-cadherin form the "minimal essential unit" to mediate cell adhesion. Cell lines expressing longer extracellular domains or N-cadherin wild type cells formed larger cellular aggregates than those expressing shorter aggregates. However, adhesion strength, as measured by a shearing test, did not reveal any differences among these aggregative cell lines, suggesting that the first two domains of N-cadherin cells generate the same strength of adhesive activity as longer extracellular domain cells. Furthermore, truncations of the first two domains of N-cadherin are also sufficient to form cisdimerization at an adhesive junction. Our findings suggest that the extracellular domains of N-cadherin have distinct roles in cell adhesion, i.e. the first two domains are responsible for homophilic adhesion activity, and the other domains promote adhesion efficiency most likely by positioning essential domains relatively far out from the cell surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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